RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SIGLEC7Q9Y286 467 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ITPR3Q14573 2671 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC119BA6NIH7 251 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 A6NIZ1 184 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC2A10O95528 541 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CD14P08571 375 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RAP1BP61224 184 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RAP1AP62834 184 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HGFACQ04756 655 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NRN1LQ496H8 165 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM205BPQ63HN1 556 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF519Q8TB69 540 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NSMAFQ92636 917 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HTRA1Q92743 480 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NDEL1Q9GZM8 345 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TMCC3Q9ULS5 477 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GYG2O15488 501 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MGRN1O60291 552 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10H3O60404 316 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT36O76013 467 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB2O95178 105 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB36O95755 333 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NR2C1P13056 603 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CDAP32320 146 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGA2P52926 109 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FMODQ06828 376 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf71Q6IPW1 123 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FNDC8Q8TC99 324 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB9Q96DX5 294 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 Q96MF0 132 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF121Q9H920 327 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SIAEQ9HAT2 523 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CA10Q9NS85 328 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 F8P00451 2351 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNGR2P38484 337 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRNB3Q05901 458 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB39AQ14964 217 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SGCAQ16586 387 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MST1LQ2TV78 715 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 VHLLQ6RSH7 139 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC18Q8N456 261 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP37Q8NFH4 326 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP4-204ENST00000416021 Q96M85 177 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNG6Q9BXT2 260 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGIXQ9H6Y5 334 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DLL4Q9NR61 685 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IL20RAQ9UHF4 553 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS13CQ709C8 3753 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 VSTM5A8MXK1 200 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF11BO00300 401 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ACOT8O14734 319 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFS7O75251 213 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 STAMBPO95630 424 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINA5P05154 406 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF35P13682 527 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FOSL1P15407 271 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NPR2P20594 1047 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINF1P36955 418 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEA2P43356 314 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC36A2Q495M3 483 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAL1Q4LDG9 190 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM122BQ7Z309 247 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO17Q96EF6 278 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 BTBD10Q9BSF8 475 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNN2Q9H2S1 579 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NRIP3Q9NQ35 241 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 USF3Q68DE3 2245 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 XKRYO14609 159 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4A8P0C604 315 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP4P12644 408 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 THBS4P35443 961 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FXYD6P3P58550 94 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf94Q6P1W5 598 aa18.27■□□□□ 0.52
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