RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 DGCR6Q14129 220 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 ANKDD1AQ495B1 522 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 NSMAFQ92636 917 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 RNF121Q9H920 327 aa26.61■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 FBXL3Q9UKT7 428 aa26.61■■□□□ 1.85
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CMTM4-202ENST00000394106 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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CMTM4-202ENST00000394106 DNM1P46Q6ZS02 220 aa26.59■■□□□ 1.85
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CMTM4-202ENST00000394106 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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CMTM4-202ENST00000394106 SLC36A2Q495M3 483 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 ZBED5Q49AG3 693 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 FAM205BPQ63HN1 556 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 MCUR1Q96AQ8 359 aa26.58■■□□□ 1.85
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CMTM4-202ENST00000394106 ALG12Q9BV10 488 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 SMURF2Q9HAU4 748 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 SPEF1Q9Y4P9 236 aa26.58■■□□□ 1.85
CMTM4-202ENST00000394106 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa26.57■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa26.57■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 A6NIZ1 184 aa26.57■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 DPPA2Q7Z7J5 298 aa26.57■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 SPIBQ01892 262 aa26.56■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 IQCCQ4KMZ1 466 aa26.56■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 SVOPLQ8N434 492 aa26.56■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 NDEL1Q9GZM8 345 aa26.56■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 THEM4Q5T1C6 240 aa26.55■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa26.55■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 SORCS2Q96PQ0 1159 aa26.55■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 KCNN2Q9H2S1 579 aa26.55■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 SIAEQ9HAT2 523 aa26.55■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 H7C1C5 153 aa26.54■■□□□ 1.84
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CMTM4-202ENST00000394106 GADD45GO95257 159 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 FABP3P05413 133 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 CD14P08571 375 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 OMPP47874 163 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 LIMS1P48059 325 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 SMIM11AP58511 58 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 DSCR9P59020 149 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 LCN6P62502 163 aa26.54■■□□□ 1.84
CMTM4-202ENST00000394106 CYP2R1Q6VVX0 501 aa26.54■■□□□ 1.84
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