RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586299.1

CYTH1-206, Transcript of cytohesin 1, human

Gene CYTH1, Length 4,423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH1-206	ENST00000586299	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299		A0A1W2PPC4	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299		F8W036	122 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	DIO1	P49895	249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MTCP1	P56278	107 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	BLOC1S1	P78537	153 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	BAK1	Q16611	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CORO6	Q6QEF8	472 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FCGR2A	P12318	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	STK11	Q15831	433 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SULF2	Q8IWU5	870 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MICU1	Q9BPX6	476 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TAS2R31	P59538	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MOB3C	Q70IA8	216 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MISP	Q8IVT2	679 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	OR52I2	Q8NH67	350 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FANCF	Q9NPI8	374 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SULT1C4	O75897	302 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	HRG	P04196	525 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF44	P15621	663 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	GABRG2	P18507	467 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	PPIC	P45877	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CAPZB	P47756	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CCR9	P51686	369 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MFAP5	Q13361	173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FGL2	Q14314	439 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	OR4K15	Q8NH41	348 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	RAB3C	Q96E17	227 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	RTTN	Q86VV8	2226 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299		A0A087WV62	115 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TSPAN11	A1L157	253 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TUBG1	P23258	451 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ARG2	P78540	354 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	OPCML	Q14982	345 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	GPR157	Q5UAW9	335 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	NICN1	Q9BSH3	213 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	P2RX6	O15547	441 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ICOSLG	O75144	302 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	PHYHIP	Q92561	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	MIB2	Q96AX9	1013 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	FCRL1	Q96LA6	429 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CSF3	P09919	207 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	EVX1	P49640	407 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SSR4	P51571	173 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	SPRED2	Q7Z698	418 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF695	Q8IW36	515 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	ENY2	Q9NPA8	101 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CYTH1-206	ENST00000586299	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299		A0A1W2PNR3	127 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	TNFSF12	O43508	249 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	DPM1	O60762	260 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	TSPAN15	O95858	294 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	ASAH1	Q13510	395 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	HTR4	Q13639	388 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CYTH1-206	ENST00000586299	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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