RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 BATF3Q9NR55 127 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 U3KQV3 271 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.1□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 J3KTA2 159 aa8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.1□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 ENPP1P22413 925 aa8.09□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.09□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.09□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 MPP4Q96JB8 637 aa8.09□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 ASB6Q9NWX5 421 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 EMC3Q9P0I2 261 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0B4J2E0 115 aa8.08□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.08□□□□□ -1.12
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