RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RNF175Q8N4F7 328 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 NPBQ8NG41 125 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM54Q969K7 222 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SLC29A1Q99808 456 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 OR51M1Q9H341 326 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CWH43Q9H720 699 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF726A6NNF4 738 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PEX7O00628 323 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAB1O14561 156 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CLIC3O95833 236 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN13O95857 204 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 FGF4P08620 206 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB5P36952 375 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RAB9AP51151 201 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RORCP51449 518 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED5Q49AG3 693 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 REEP3Q6NUK4 255 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACER1Q8TDN7 264 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GSDMAQ96QA5 445 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 OR2M2Q96R28 347 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ING4Q9UNL4 249 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 AKNAQ7Z591 1439 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVI7 797 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SMCO2A6NFE2 343 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 MOSP00540 346 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 NOVP48745 357 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CX3CR1P49238 355 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CLINT1Q14677 625 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SGCAQ16586 387 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 IQCKQ8N0W5 287 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM10Q96HG1 83 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CNTNAP1P78357 1384 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GUA9 196 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVY2 172 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CALM1P0DP23 149 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CALM2P0DP24 149 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CALM3P0DP25 149 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 MYL2P10916 166 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 GABRG1Q8N1C3 465 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 STARD8Q92502 1023 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX4Q99571 388 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 H0YIV9 168 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ASGR1P07306 291 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CCNE1P24864 410 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACTA2P62736 377 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACTG2P63267 376 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACTC1P68032 377 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACTA1P68133 377 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 TWF1Q12792 350 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCB1Q12824 385 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PRPSAP1Q14558 356 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 RDH5Q92781 318 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A7Q9HAW7 530 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A8Q9HAW9 530 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CELA1Q9UNI1 258 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y9J4 135 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CHST1O43916 411 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB6O75190 326 aa5.22□□□□□ -1.57
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