RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 H7C1Q1 480 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 CDC42EP2O14613 210 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 DHHO43323 396 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 RHCEP18577 417 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 PAX7P23759 505 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ARR3P36575 388 aa10.43□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 SEC23BQ15437 767 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.43□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 ZNF544Q6NX49 715 aa10.43□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 OAFQ86UD1 273 aa10.43□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 MCHR2Q969V1 340 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 FBXO17Q96EF6 278 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 PYURFQ96I23 114 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 SH3GL3Q99963 347 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NDE1Q9NXR1 346 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 SLC2A10O95528 541 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 SEMG1P04279 462 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 T-ENOLP0DO92 83 aa10.42□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ACVR1BP36896 505 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 GSG1Q2KHT4 349 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 RINLQ6ZS11 566 aa10.42□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 OR52J3Q8NH60 311 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 C18orf12Q96KH6 178 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 SEPHS2Q99611 448 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 CA10Q9NS85 328 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PRQ8 180 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NPIPB13A6NJU9 1138 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NPIPB4C9JG80 1138 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 PDE5AO76074 875 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 RAB36O95755 333 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 INHBBP09529 407 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ATP6V1B2P21281 511 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 THBS4P35443 961 aa10.41□□□□□ -0.74
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NISCH-214ENST00000490425 SLC9A3P48764 834 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ZNF84P51523 738 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 ERVK-25P63136 954 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 CD47Q08722 323 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 TNK1Q13470 666 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 DGCR6Q14129 220 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 RAB39AQ14964 217 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 MST1LQ2TV78 715 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 KRT80Q6KB66 452 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 OR4F15Q8NGB8 312 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 NSMAFQ92636 917 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-214ENST00000490425 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.41□□□□□ -0.74
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