RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTGS2P35354 604 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRYBB2P43320 205 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCL11P51671 97 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARG2P78540 354 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAM1Q15629 374 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPB2Q16082 182 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCK2Q16822 640 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GXYLT1Q4G148 440 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDONQ4KMG0 1287 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF766Q5HY98 468 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIGD4Q8IY51 512 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCFD2Q8NI22 146 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TM9SF4Q92544 642 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 UFD1Q92890 307 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 MED18Q9BUE0 208 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUAK2Q9H093 628 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PNR3 127 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 G3V3Y1 287 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLPP2O43688 288 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPX5O75715 221 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAPPC6AO75865 159 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL1AP01583 271 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TACSTD2P09758 323 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DOBP13765 273 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENPP1P22413 925 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SHC1P29353 583 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SFTPDP35247 375 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 OPRL1P41146 370 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD97P48960 835 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC16A1P53985 500 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF45Q02386 682 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GLO1Q04760 184 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 EGR3Q06889 387 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC17A1Q14916 467 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SHFQ7M4L6 423 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GGNQ86UU5 652 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC20BQ86Y33 519 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ITFG2Q969R8 447 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SFXN2Q96NB2 322 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CENPOQ9BU64 300 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALG8Q9BVK2 526 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT4Q9H2B2 425 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF122Q9H9V4 155 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLK13Q9UKR3 277 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTPRBP23467 1997 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 A6NL46 340 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF726A6NNF4 738 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACOT7O00154 380 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCTN6O00399 190 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 OGG1O15527 345 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 AQP8O94778 261 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHG1P01857 330 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DPB1P04440 258 aa8.25□□□□□ -1.09
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