RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM54Q969K7 222 aa11.25□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.25□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.22□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNAB3O43448 404 aa11.21□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMO6PO60774 539 aa11.21□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGA4P0DJD7 388 aa11.21□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A2P23975 617 aa11.21□□□□□ -0.61
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.21□□□□□ -0.61
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