RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX5Q99593 518 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ7Q99807 217 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF649Q9BS31 505 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NUAK2Q9H093 628 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51E2Q9H255 320 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT4Q9H2B2 425 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SIAEQ9HAT2 523 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 STUB1Q9UNE7 303 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 B9D1Q9UPM9 204 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 POLHQ9Y253 713 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RASD1Q9Y272 281 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RAXQ9Y2V3 346 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PNV4 684 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5H15A6NDH6 313 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF726A6NNF4 738 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 J3QLW9 94 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DNPH1O43598 174 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A7O60669 478 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 F10P00742 488 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DQA2P01906 255 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DPB1P04440 258 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NR2C1P13056 603 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF19P17023 458 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CD53P19397 219 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CELP19835 753 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF1P27539 372 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PYCR1P32322 319 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX19P40855 299 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CARD18P57730 90 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 NCS1P62166 190 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GLO1Q04760 184 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MFAP5Q13361 173 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP6Q13520 282 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX1Q16384 188 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KLBQ86Z14 1044 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SYS1Q8N2H4 156 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC8Q8TC99 324 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SFXN2Q96NB2 322 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TSSK2Q96PF2 358 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF32Q9H0A6 362 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 16.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TIGARQ9NQ88 270 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 DEPPQ9NTK1 212 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP7P3A6NL99 342 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C1C5 153 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PHYHO14832 338 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SP1P08047 785 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAR1AP10644 381 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DOBP13765 273 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK2P20155 84 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRA5P31644 462 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX6P35712 828 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBB2P43320 205 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL11P51671 97 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RAC3P60763 192 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN6P62502 163 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ARG2P78540 354 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 PLGLB1Q02325 96 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXO1Q12778 655 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAM1Q15629 374 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC58Q4VC31 144 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 THEM4Q5T1C6 240 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 GPAT4Q86UL3 456 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 SULF2Q8IWU5 870 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms