RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 HOXD12P35452 270 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZP2Q05996 745 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CLMPQ9H6B4 373 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.63□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 F13BP05160 661 aa8.63□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 LYRM4Q9HD34 91 aa8.62□□□□□ -1.03
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CUX1-201ENST00000292535 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 V9GYS6 101 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 TNFRSF1BP20333 461 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 CBLL1Q75N03 491 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 NEURL3Q96EH8 262 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HES7Q9BYE0 225 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 DLL4Q9NR61 685 aa8.62□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 AQP9O43315 295 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HOXC5Q00444 222 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 LGI3Q8N145 548 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 METTL4Q8N3J2 472 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ABHD4Q8TB40 342 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.61□□□□□ -1.03
CUX1-201ENST00000292535 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.61□□□□□ -1.03
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