RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 SLC11A1P49279 550 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 MZT1Q08AG7 82 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PELI3Q8N2H9 469 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ZNF566Q969W8 418 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ACTL6BO94805 426 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ECI1P42126 302 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CCNJQ5T5M9 372 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 BCL2L11O43521 198 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CRYBA1P05813 215 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 NAGAP17050 411 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TSPAN31Q12999 210 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 MMP26Q9NRE1 261 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ELOCQ15369 112 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CUTCQ9NTM9 273 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 K7ERQ8 282 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CCSO14618 274 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GJB5O95377 273 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 IGHG1P01857 330 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FCGR2CP31995 323 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FABP5Q01469 135 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 KIRREL1Q96J84 757 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 LINC00052Q96N35 136 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 AOAHP28039 575 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ADRA1AP35348 466 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 REEP5Q00765 189 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FAM3CQ92520 227 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 OR51I2Q9H344 312 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 NENFQ9UMX5 172 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 SYT17Q9BSW7 474 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 C1orf198Q9H425 327 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ASB11Q8WXH4 323 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 F6UZH7 168 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 CLDN1O95832 211 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 BTNL8Q6UX41 500 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 VRK3Q8IV63 474 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ZNF320A2RRD8 509 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GABRA2P47869 451 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 OR2A2Q6IF42 318 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 HNF4GQ14541 408 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 MEP1BQ16820 701 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PRR18Q8N4B5 295 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 A0A1W2PP55 124 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 HOXB2P14652 356 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 FCER1GP30273 86 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PFKMP08237 780 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 S100A7P31151 101 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 LCN6P62502 163 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 NOGQ13253 232 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC2-201ENST00000261609 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.62□□□□□ -1.35
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