RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	RAB36	O95755	333 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RNF224	P0DH78	156 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SPI1	P17947	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	AHCY	P23526	432 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GDF1	P27539	372 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	DCK	P27707	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ACVR1B	P36896	505 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TGFBR2	P37173	567 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CD79B	P40259	229 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	STAR	P49675	285 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	MEOX1	P50221	254 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A1	P53007	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CLDN20	P56880	219 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LCN6	P62502	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RUNX1T1	Q06455	604 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GGTLC2	Q14390	218 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	MELK	Q14680	651 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL12	Q53G59	568 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF766	Q5HY98	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF787	Q6DD87	383 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LEG1	Q6P5S2	330 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TRIL	Q7L0X0	811 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GPR141	Q7Z602	305 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PXK	Q7Z7A4	578 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GHDC	Q8N2G8	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	FCGR1B	Q92637	280 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	RORB	Q92753	470 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OTULIN	Q96BN8	352 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	YIPF6	Q96EC8	236 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TXNDC15	Q96J42	360 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TSSK2	Q96PF2	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SNX18	Q96RF0	628 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	JAM3	Q9BX67	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	IRGM	A1A4Y4	181 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PRSS37	A4D1T9	235 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	AQP7P3	A6NL99	342 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	FAM166B	A8MTA8	275 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TNFSF11	O14788	317 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF9	O43307	516 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SERPINI2	O75830	405 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TRAPPC6A	O75865	159 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GLCE	O94923	617 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR6A2	O95222	327 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TF	P02787	698 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SBK2	P0C263	348 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	IFNGR1	P15260	489 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CD46	P15529	392 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PYCR1	P32322	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TTK	P33981	857 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LIPA	P38571	399 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEA5	P43359	124 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	UQCRFS1	P47985	274 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LHX2	P50458	406 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC35A1	P78382	337 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ARG2	P78540	354 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	HSF1	Q00613	529 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	KLRB1	Q12918	225 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	TOMM20	Q15388	145 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GPR107	Q5VW38	600 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ADCK1	Q86TW2	530 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	OR6V1	Q8N148	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PVT1-222	ENST00000613916	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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