RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590205.2

CACNA1A-210, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 3,340 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-210ENST00000590205 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.51□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A0G2JNG1 304 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A1W2PRG6 482 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 A8MXK9 166 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 J3QLW9 94 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 XRCC3O43542 346 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 STATHP02808 62 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF19P17023 458 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 MPLP40238 635 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ROM1Q03395 351 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KIR2DS5Q14953 304 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 DEFB134Q4QY38 66 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 PTX4Q96A99 478 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ORAI1Q96D31 301 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 STMN3Q9NZ72 180 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A1W2PQD3 144 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR5K4A6NMS3 321 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 TO15178 435 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ZFPL1O95159 310 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 HLA-GP17693 338 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 HOXC12P31275 282 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SGCAQ16586 387 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 Q6ZTK2 550 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF524Q96C55 264 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR14A2Q96R54 314 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CACNA1HO95180 2353 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SERINC4A6NH21 518 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 H7C417 338 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 HCRTR1O43613 425 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NPIPB7O75200 414 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 PNMTP11086 282 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SDHAP31040 664 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 GABRA3P34903 492 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 LTBQ06643 244 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC3A1Q07837 685 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 AANATQ16613 207 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 Q499Y3 187 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM65Q6PI78 240 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 BCORP1Q8N888 145 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CEP76Q8TAP6 659 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 THRSPQ92748 146 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NOX4Q9NPH5 578 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 LNP1A1A4G5 178 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 TRIM77I1YAP6 450 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SULT1C2O00338 296 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 TM4SF5O14894 197 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 PDGFAP04085 211 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CD3GP09693 182 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CXCL2P19875 107 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 PYCR1P32322 319 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CCR6P51684 374 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 AP3S2P59780 193 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA1A-210ENST00000590205 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms