RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 HNF1AP20823 631 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FOXL2P58012 376 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SCN1BQ07699 218 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 AVPI1Q5T686 147 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C3Q8NH37 302 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ASB15Q8WXK1 588 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 DIO2Q92813 273 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 EDAQ92838 391 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RBP7Q96R05 134 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR6C1Q96RD1 312 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 STACQ99469 402 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ASPNQ9BXN1 380 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RTTNQ86VV8 2226 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FAM221AA4D161 298 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CDHR4A6H8M9 788 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 E9PI62 339 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 AIPO00170 330 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TXNL1O43396 289 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FOXS1O43638 330 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RAD1O60671 282 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CDRT1O95170 752 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FGF2P09038 288 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FOLR1P15328 257 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CBR1P16152 277 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PCMT1P22061 227 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CXCR1P25024 350 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ACVR2AP27037 513 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PTGFRP43088 359 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 DMWDQ09019 674 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PGGHGQ32M88 737 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf42Q6IC83 251 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ARL9Q6T311 187 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM10Q96HG1 83 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HHATLQ9HCP6 504 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GPR160Q9UJ42 338 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RARRES3Q9UL19 164 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 VCANP13611 3396 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 THADAQ6YHU6 1953 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LRRN3E7EW58 273 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 J3QLW9 94 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA12AO43301 675 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 THBS1P07996 1170 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TFPIP10646 304 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF19P17023 458 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PAX6P26367 422 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC6A6P31641 620 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PSG6Q00889 435 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ECH1Q13011 328 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 IRF3Q14653 427 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM163Q8TC26 289 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC46Q96FV0 321 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 UBQLN3Q9H347 655 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ABCB9Q9NP78 766 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TREM1Q9NP99 234 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 COL4A3Q01955 1670 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PR77 199 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf98E9PRG8 122 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SMLR1H3BR10 107 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB1BP1O14713 200 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OIP5O43482 229 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV3-19P01714 112 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CRHP06850 196 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00614P0C842 121 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NRG3P56975 720 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RAB5BP61020 215 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 POU4F2Q12837 409 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ULK3Q6PHR2 472 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 KLBQ86Z14 1044 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 BVESQ8NE79 360 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LMF1Q96S06 567 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms