RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 EXD2Q9NVH0 621 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 NFASCO94856 1347 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 MSH6P52701 1360 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 TOP2BQ02880 1626 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.55□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 MED6O75586 246 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 UPK3AO75631 287 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 IGHV2-5P01817 119 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 FGF1P05230 155 aa2.55□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 HSD17B2P37059 387 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 UBE2AP49459 152 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 HMGCS1Q01581 520 aa2.55□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 KDM7AQ6ZMT4 941 aa2.55□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 MADDQ8WXG6 1647 aa2.55□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 LHX9Q9NQ69 397 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 CEP164Q9UPV0 1460 aa2.55□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 PBRM1Q86U86 1689 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 CDHR2Q9BYE9 1310 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 A0A1B0GVI7 797 aa2.54□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 ANGPTL7O43827 346 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 ERLIN2O94905 339 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 C1orf105O95561 183 aa2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 IGKV2D-28P01615 120 aa2.54□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 EPS15P42566 896 aa2.54□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 RPS21P63220 83 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 ZNF77Q15935 545 aa2.54□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 ZFP90Q8TF47 636 aa2.54□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa2.53□□□□□ -2
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RBM39-211ENST00000426951 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.53□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.53□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 CD300LFQ8TDQ1 290 aa2.53□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB18Q99592 522 aa2.53□□□□□ -2
RBM39-211ENST00000426951 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.53□□□□□ -2
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