RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RGNQ15493 299 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 STUMQ69YW2 141 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADNP2Q6IQ32 1131 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM71F2Q6NXP2 309 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SYT10Q6XYQ8 523 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RABEPKQ7Z6M1 372 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MISPQ8IVT2 679 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PIANPQ8IYJ0 282 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ELMOD2Q8IZ81 293 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPC24Q8NBT2 197 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IPMKQ8NFU5 416 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR10A7Q8NGE5 316 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 COQ8AQ8NI60 647 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C15orf40Q8WUR7 153 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC13A3Q8WWT9 602 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SHC3Q92529 594 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MED8Q96G25 268 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ACAT2Q9BWD1 397 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM117Q9H0C3 514 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LINC00597Q9H2U6 94 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 REEP4Q9H6H4 257 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SGK2Q9HBY8 427 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 VAT1LQ9HCJ6 419 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GIN1Q9NXP7 522 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MTRRQ9UBK8 725 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF639Q9UID6 485 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RAB23Q9ULC3 237 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CACNA1DQ01668 2161 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MSH6P52701 1360 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SCN4AP35499 1836 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM120BA0PK00 339 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C5orf63A6NC05 138 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CLDN5O00501 218 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RASGRF2O14827 1237 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 H6PDO95479 791 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGHG4P01861 327 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HLA-DQA1P01909 254 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HLA-DPB1P04440 258 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CCDC130P13994 396 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MMP11P24347 488 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAP3K8P41279 467 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RFX3P48380 749 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CCR8P51685 355 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAB21L1Q13394 359 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM53BQ14153 422 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IHHQ14623 411 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZSCAN26Q16670 478 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DUSP7Q16829 419 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C2orf76Q3KRA6 126 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DEFB134Q4QY38 66 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GUSBP11Q6P575 273 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CATSPER4Q7RTX7 472 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CALHM1Q8IU99 346 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC35F2Q8IXU6 374 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC38A6Q8IZM9 456 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CLEC4FQ8N1N0 589 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FNDC5Q8NAU1 212 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR52H1Q8NGJ2 320 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR10T2Q8NGX3 314 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ABHD3Q8WU67 409 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM3CQ92520 227 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UFD1Q92890 307 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HGDQ93099 445 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SAMD8Q96LT4 415 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF681Q96N22 645 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RIT2Q99578 217 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CCT7Q99832 543 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF649Q9BS31 505 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RAB17Q9H0T7 212 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GBA3Q9H227 469 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DPH5Q9H2P9 285 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MCCC2Q9HCC0 563 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ISYNA1Q9NPH2 558 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMOD2Q9NZR1 351 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LAMP5Q9UJQ1 280 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MGAT4BQ9UQ53 548 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RASD1Q9Y272 281 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IKBKGQ9Y6K9 419 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TENM3Q9P273 2699 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A0A0U1RQV1 116 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BTNL10A8MVZ5 291 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZSCAN12O43309 604 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SSX5O60225 188 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CNMDO75829 334 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATP5LO75964 103 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CD74P04233 296 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms