RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa24.39■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RBP7Q96R05 134 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYT4Q9H2B2 425 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF122Q9H9V4 155 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCE1Q9Y256 329 aa24.39■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFAIP8O95379 198 aa24.38■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A1P53007 311 aa24.38■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T4Q8NH00 348 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPT1CQ8TCG5 803 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT2BQ93097 391 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNK17Q96T54 332 aa24.38■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GLRX2Q9NS18 164 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARPBPQ9NWS1 579 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A23A1A5C7 686 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC1A7O00341 560 aa24.37■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.37■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6N1Q8NGY5 312 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC8Q8TC99 324 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDOQ99489 341 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCO1Q9HAY6 547 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMBNQ9NP70 447 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC4AQ9UMR7 237 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPBD1B2RD01 187 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRABP1P29762 137 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPTNQ6XPR3 784 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUSC5Q8IXB3 177 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM45BQ96B21 275 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2M2Q96R28 347 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM9SF2Q99805 663 aa24.36■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CD8B2A6NJW9 211 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A31A6NKX4 558 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PGA3P0DJD8 388 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPI1P17947 270 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CSNK1A1P48729 337 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCN1P1Q5VSP4 162 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2A2Q6IF42 318 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF540Q8NDQ6 660 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB6Q9NWX5 421 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUAK2Q9H093 628 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FKBP7Q9Y680 259 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V1E1P36543 226 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTNR1AP48039 350 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPAP49450 140 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED1Q13445 227 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35D3Q5M8T2 416 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6K6Q8NGW6 343 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSSK2Q96PF2 358 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEAD3Q99594 435 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB10A6NFE3 127 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF432O94892 652 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-201ENST00000318988 DBTP11182 482 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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