RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 HGDQ93099 445 aa22.97■■□□□ 1.27
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF749O43361 778 aa22.96■■□□□ 1.27
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HOXB3-201ENST00000311626 ALOX5APP20292 161 aa22.94■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 MEP1BQ16820 701 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 COL28A1Q2UY09 1125 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 CMTM3Q96MX0 182 aa22.94■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC120Q96HB5 630 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 INTS14Q96SY0 518 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 TAS2R5Q9NYW4 299 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 COL4A2P08572 1712 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 I3L521 148 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 TGM6O95932 706 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 WNT11O96014 354 aa22.92■■□□□ 1.26
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