RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RORBQ92753 470 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA1Q9UND3 350 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS37A4D1T9 235 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NIZ1 184 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 INMTO95050 263 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD18P57730 90 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAP1BP61224 184 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAP1AP62834 184 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR141Q7Z602 305 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FCGR1BQ92637 280 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CRELD1Q96HD1 420 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC15Q96J42 360 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC14L2O76054 403 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PTHP01270 115 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHA1P01876 353 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LCKP06239 509 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PMP22Q01453 160 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RUNX1T1Q06455 604 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GGTLC2Q14390 218 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PON3Q15166 354 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GPAT4Q86UL3 456 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13F1Q8NGS4 319 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TSSK2Q96PF2 358 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 JAM3Q9BX67 310 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT4Q9H2B2 425 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MED29Q9NX70 200 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GLCEO94923 617 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 VAMP5O95183 116 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PDGFAP04085 211 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF708P17019 499 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TTKP33981 857 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1E1P36543 226 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN18P56856 261 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 POU4F2Q12837 409 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01590Q5TEZ4 76 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN1P1Q5VSP4 162 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PM20D2Q8IYS1 436 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51L1Q8NGJ5 315 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T4Q8NH00 348 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10D3Q8NH80 312 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 UCN2Q96RP3 112 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRL4Q9HBW9 690 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MOKQ9UQ07 419 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPGQ9Y5X9 500 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FRYQ5TBA9 3013 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A23A1A5C7 686 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 DCTN6O00399 190 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL13O43927 109 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTL6AO96019 429 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB2P05107 769 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SBK2P0C263 348 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF43P17038 809 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP1P22413 925 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV1P50549 477 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 POU4F3Q15319 338 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL2A1Q16548 175 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6V1Q8N148 313 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NEIL3Q8TAT5 605 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK17Q96T54 332 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAXQ9Y2V3 346 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL12AP19105 171 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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