RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED29Q9NX70 200 aa20.88■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A1B0GVC2 190 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLPTM1O96005 669 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPN1P15169 458 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ST3GAL4Q11206 333 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 POU4F3Q15319 338 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHL12Q53G59 568 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM205BPQ63HN1 556 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX18Q96RF0 628 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TEAD3Q99594 435 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHL13Q9P2N7 655 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 A6NIZ1 184 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RGS10O43665 173 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 GYPBP06028 91 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAP1BP61224 184 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAP1AP62834 184 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RUNX1T1Q06455 604 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC17A1Q14916 467 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.87■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS37A4D1T9 235 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 H7C1C5 153 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 WISP2O76076 250 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RENP00797 406 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDK1P06493 297 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC25A1P53007 311 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 LCN6P62502 163 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 MVKQ03426 396 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPARTQ8N0X7 666 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 STX19Q8N4C7 294 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNFT2Q96EX2 444 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYT4Q9H2B2 425 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB6Q9NWX5 421 aa20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 STSP08842 583 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC16A1P53985 500 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 BIDP55957 195 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB40BQ12829 278 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMED1Q13445 227 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 NADK2Q4G0N4 442 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHL22Q53GT1 634 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 EXD3Q8N9H8 876 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC182A6NF36 153 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 AQP7O14520 342 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPI1P17947 270 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 LGALS12Q96DT0 336 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRELD1Q96HD1 420 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMC6Q9BV81 110 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 LUZP4Q9P127 313 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.85■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFAP2AP05549 437 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 LGALS3BPQ08380 585 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PON3Q15166 354 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 FCRLAQ7L513 359 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR6V1Q8N148 313 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR2T4Q8NH00 348 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR6X1Q8NH79 312 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSSK2Q96PF2 358 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNK17Q96T54 332 aa20.84■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATMQ13315 3056 aa20.83■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 IRGMA1A4Y4 181 aa20.83■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.83■□□□□ 0.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC35F4A4IF30 521 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms