RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577473.1

MIR4643-201, Transcript of microRNA 4643, humanhuman

BASIC

Gene MIR4643, Length 78 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR4643-201ENST00000577473 SNX1Q13596 522 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 FAM222AQ5U5X8 452 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 ZNF546Q86UE3 836 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 NOXO1Q8NFA2 376 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 VN1R2Q8NFZ6 395 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 GIPC3Q8TF64 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 WDR34Q96EX3 536 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 SLC6A7Q99884 636 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 RHBGQ9H310 441 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 EDA2RQ9HAV5 297 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 RETNQ9HD89 108 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 PALMDQ9NP74 551 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 CALYQ9NYX4 217 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 TMOD2Q9NZR1 351 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 SPATA7Q9P0W8 599 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 TBK1Q9UHD2 729 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 NPIPA1Q9UND3 350 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 ICE1Q9Y2F5 2266 aa-0.03□□□□□ -2.41
MIR4643-201ENST00000577473 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 A0A0U1RQV1 116 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CCDC182A6NF36 153 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TRDCB7Z8K6 153 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 HAS3O00219 553 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 MFNGO00587 321 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 AQP9O43315 295 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 LCA5LO95447 670 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TBXA2RP21731 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 PSMB5P28074 263 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 EPS15P42566 896 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 GALR1P47211 349 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 IDH2P48735 452 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 KIAA1024LP59773 190 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RPS21P63220 83 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FAM53BQ14153 422 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TOMM20Q15388 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TYSND1Q2T9J0 566 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 SMU1Q2TAY7 513 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 BEND3Q5T5X7 828 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TMEM270Q6UE05 265 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 ZNF410Q86VK4 478 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TMEM256Q8N2U0 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 STPG2Q8N412 459 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 OR5D13Q8NGL4 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 ST7LQ8TDW4 575 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 NCLNQ969V3 563 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 VSTM2LQ96N03 204 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RUFY1Q96T51 708 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 SLC25A2Q9BXI2 301 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CAPS2Q9BXY5 557 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 SLC5A7Q9GZV3 580 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 SIRPDQ9H106 197 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 GBA3Q9H227 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 DUSP21Q9H596 190 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FAM49BQ9NUQ9 324 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CR1P17927 2039 aa-0.04□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 MYO9BQ13459 2157 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FIBPO43427 364 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CXCL13O43927 109 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 P0DMU3 169 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FAM231AP0DMU4 169 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FAM231CP0DMU5 169 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 PTGFRP43088 359 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RGNQ15493 299 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 MAPK6Q16659 721 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 PGGHGQ32M88 737 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 OR8H2Q8N162 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 ZADH2Q8N4Q0 377 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FNDC5Q8NAU1 212 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 TMEM185AQ8NFB2 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 SDR42E1Q8WUS8 393 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 BLNKQ8WV28 456 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FGF14Q92915 247 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 ZNF681Q96N22 645 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RHOJQ9H4E5 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 LY9Q9HBG7 655 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 COMMD8Q9NX08 183 aa-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-0.06□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CEACAM18A8MTB9 384 aa-0.06□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 RS1O15537 224 aa-0.06□□□□□ -2.42
MIR4643-201ENST00000577473 CXCL14O95715 111 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms