RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM61Q5EBN2 209 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE2NLQ5JXB2 153 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 OLFML2AQ68BL7 652 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR51L1Q8NGJ5 315 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SESN1Q9Y6P5 492 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR2M5A3KFT3 312 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOR1AO14656 332 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXS1O43638 330 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SULT1B1O43704 296 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL5P05113 134 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 AP3S2P59780 193 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPAN5P62079 268 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SFXN2Q96NB2 322 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 G6PC3Q9BUM1 346 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 LDAHQ9H6V9 325 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 Q9N2J8 555 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP54Q96N23 3096 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 FLRT2O43155 660 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NDUFA2O43678 99 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTNSO60931 367 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPPPO94811 219 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFNGR1P15260 489 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIRPAP78324 504 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NDUFAF6Q330K2 333 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAXDQ8IW45 347 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 AVL9Q8NBF6 648 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 BEST4Q8NFU0 473 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDOQ99489 341 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 RXFP3Q9NSD7 469 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF292O60281 2723 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A087WUJ7 227 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PPK0 400 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB7A8K855 629 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRPGP15A8MWD9 76 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRAMEF2O60811 474 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 LGALS3BPQ08380 585 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF273Q14593 569 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR14A16Q8NHC5 309 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 HRASLSQ9HDD0 168 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 GABARAPH6UMI1 98 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSTAP01040 98 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NMBP08949 121 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CT45A8P0DMV1 189 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CT45A9P0DMV2 189 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTSEP14091 401 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXCL2P19875 107 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL4P36578 427 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 MNDAP41218 407 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 DIO1P49895 249 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PON3Q15166 354 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CT45A2Q5DJT8 189 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 Q6ZTK2 550 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF595Q8IYB9 648 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNX33Q8WV41 574 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNRF4Q8WWF5 429 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ST8SIA4Q92187 359 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC00052Q96N35 136 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 DGAT2Q96PD7 388 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERINC4A6NH21 518 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMSDA8MTL9 139 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGF2P09038 288 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF806P0C7X5 589 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR3P46089 330 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 C1orf61Q13536 156 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 FZD2Q14332 565 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 NNATQ16517 81 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYT9Q86SS6 491 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms