RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC6A7	Q99884	636 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB33B	Q9H082	229 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FZD8	Q9H461	694 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AIFM1	O95831	613 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMO2	P25791	158 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSD3B2	P26439	372 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MST1	P26927	711 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC6A11	P48066	632 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP1B3	P54709	279 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LTB	Q06643	244 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGGHG	Q32M88	737 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEST	Q5EB52	335 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXPE1	Q8N323	547 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SURF4	O15260	269 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	JTB	O76095	146 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS56	P0CW18	603 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSRR	P14616	1297 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDK2	P24941	298 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL2RG	P31785	369 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN12	P56749	244 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	VAMP3	Q15836	100 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ISX	Q2M1V0	245 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB8B	Q92930	207 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GKN1	Q9NS71	199 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL5C	A6NH57	179 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7ERU9	68 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPRIN2	O60269	458 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GBA	P04062	536 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASGR2	P07307	311 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP11	P24347	488 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCKAR	P32238	428 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSPB3	Q12988	150 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MED27	Q6P2C8	311 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC18	Q8N456	261 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2E3	Q969T4	207 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNX22	Q96L94	193 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SGPP1	Q9BX95	441 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNIH4	Q9P003	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		F5H5T6	163 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPN1LW	P04000	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADCYAP1	P18509	176 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	7.54	□□□□□ -1.2	2e-9	■■■■□ 26.7
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOX2	P48431	317 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERVFC1-1	P60608	527 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPC2	Q8N158	579 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MR1	Q95460	341 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A28	Q96A46	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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