RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 SGCZQ96LD1 299 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 HMSDA8MTL9 139 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 FBP1P09467 338 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 SRRQ9GZT4 340 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GPR173Q9NS66 373 aa5.12□□□□□ -1.59
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