RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 VAMP5O95183 116 aa21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 GRPRP30550 384 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR4P46093 362 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 H3F3AP84243 136 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FAHD1Q6P587 224 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 FEVQ99581 238 aa21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.99■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 RASD1Q9Y272 281 aa20.99■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-214ENST00000592483 AKR7A3O95154 331 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RCBTB2O95199 551 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 DAG1Q14118 895 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 POU4F3Q15319 338 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2A2Q6IF42 318 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP8Q8N3A8 854 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM99Q8N816 258 aa20.96■□□□□ 0.95
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