RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NCS1P62166 190 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ZXDBP98169 803 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 TXN2Q99757 166 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PLK3Q9H4B4 646 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF44P15621 663 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 CA13Q8N1Q1 262 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 PDXPQ96GD0 296 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 NOX3Q9HBY0 568 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2T11Q8NH01 316 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 AP1S3Q96PC3 154 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 GABARAPO95166 117 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PAPLNO95428 1278 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZSR9 355 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RAB3CQ96E17 227 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CMTM3Q96MX0 182 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 OXGR1Q96P68 337 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PIGFQ07326 219 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 STK11Q15831 433 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 GON7Q9BXV9 100 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPK0 400 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 PLATP00750 562 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 BIDP55957 195 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 IL13RA1P78552 427 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A0A6YYH2 397 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 A6NJ64 397 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 FZD6O60353 706 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 SULT1C4O75897 302 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 NPIPA8P0DM63 369 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 GABRR1P24046 479 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 DAPP51397 102 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 MTCP1P56278 107 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 SELPLGQ14242 412 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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