RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487500.2

RPL7-208, Transcript of ribosomal protein L7, human

TSL 1 (best)

Gene RPL7, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell body (neuron), Dendrite .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL7-208	ENST00000487500	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500		A0A0G2JMP0	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MYMK	A6NI61	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500		H3BMM5	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NKX2-8	O15522	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SNAI2	O43623	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FADS1	O60427	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PLIN3	O60664	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FCMR	O60667	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SDC3	O75056	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF217	O75362	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CHRNG	P07510	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ALPI	P09923	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PNMT	P11086	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FGF5	P12034	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GP1BB	P13224	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ACP5	P13686	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PAX6	P26367	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CASP1	P29466	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NR4A2	P43354	598 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MAGEA3	P43357	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MMP13	P45452	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RAB28	P51157	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF75D	P51815	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	EFNA5	P52803	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MFAP4	P55083	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CLDN6	P56747	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SLC37A1	P57057	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RAP1B	P61224	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CCL7	P80098	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	VLDLR	P98155	873 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	EXT1	Q16394	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	HLA-B	Q31612	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RFX4	Q33E94	735 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	MED8	Q96G25	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL7-208	ENST00000487500	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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