RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF225Q9UK10 706 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 MOKQ9UQ07 419 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 GJE1A6NN92 205 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 KLF11O14901 512 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 RGS14O43566 566 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 KRT6AP02538 564 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 ACP2P11117 423 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRPS2P11908 318 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 HMOX2P30519 316 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 24.7
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RPS6KC1-203ENST00000468069 LGALS3BPQ08380 585 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIP10Q15642 601 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 DUSP5Q16690 384 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 APH1AQ96BI3 265 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNA7Q96RP8 456 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS6KC1-203ENST00000468069 TIMM22Q9Y584 194 aa4.84□□□□□ -1.63
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RPS6KC1-203ENST00000468069 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.84□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCDC189A1A4V9 331 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 A8MT66 165 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.83□□□□□ -1.64
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ITGA5P08648 1049 aa4.83□□□□□ -1.64
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ALOX5P09917 674 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 T-ENOLP0DO92 83 aa4.83□□□□□ -1.64
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RPS6KC1-203ENST00000468069 TFPIP10646 304 aa4.83□□□□□ -1.64
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RPS6KC1-203ENST00000468069 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 PGCP20142 388 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 ELK4P28324 431 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 SERPINF1P36955 418 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSD17B3P37058 310 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF763Q0D2J5 394 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 RASA2Q15283 850 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 GABRA6Q16445 453 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDC73Q6P1J9 531 aa4.83□□□□□ -1.64
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