RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395761.3

CXCL1-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL1, Length 1,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1-201ENST00000395761 FAPQ12884 760 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ITGADQ13349 1161 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 RIPK1Q13546 671 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 DGCR6Q14129 220 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 OR2T29Q8NH02 315 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 OR52J3Q8NH60 311 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 LIPHQ8WWY8 451 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 S100PBPQ96BU1 408 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 C14orf79Q96F83 325 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 MED18Q9BUE0 208 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ASB6Q9NWX5 421 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 MED29Q9NX70 200 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 MALT1Q9UDY8 824 aa14.6□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 PDLIM1O00151 329 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 UPK3AO75631 287 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 TIPRLO75663 272 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 OR6A2O95222 327 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 COX5AP20674 150 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 AQP2P41181 271 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 KRTAP10-9P60411 292 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ZP4Q12836 540 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 SEC23BQ15437 767 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ATP6AP1Q15904 470 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 PXKQ7Z7A4 578 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 EMC6Q9BV81 110 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 UPB1Q9UBR1 384 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 FBN2P35556 2912 aa14.59□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 ITPR2Q14571 2701 aa14.58□□□□□ -0.07
CXCL1-201ENST00000395761 A6NNC1 897 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 RNF13O43567 381 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 ITGA5P08648 1049 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 IL32P24001 234 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 SSTR2P30874 369 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 RRM2P31350 389 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 LIMS1P48059 325 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 LAPTM4AQ15012 233 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 FGD3Q5JSP0 725 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 LINGO2Q7L985 606 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 OR2M2Q96R28 347 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 FUZQ9BT04 418 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 BDH2Q9BUT1 245 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 NTN4Q9HB63 628 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 RCE1Q9Y256 329 aa14.58□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 SLC35F4A4IF30 521 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 CASKO14936 926 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 SIAH2O43255 324 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 RAD51DO75771 328 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 GADD45GO95257 159 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 F13BP05160 661 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 TSPAN19P0C672 248 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 IFNGR1P15260 489 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 PPP3CBP16298 524 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 GPR4P46093 362 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 SPIBQ01892 262 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 FHL1Q13642 323 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 CARD17Q5XLA6 110 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 TMEM123Q8N131 208 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 PKP2Q99959 881 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 OR10A4Q9H209 315 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.57□□□□□ -0.08
CXCL1-201ENST00000395761 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms