RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-202ENST00000349984 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCR6-202ENST00000349984 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.65□□□□□ -1.34
CCR6-202ENST00000349984 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GTL3 188 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SSNA1O43805 119 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FMO6PO60774 539 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SPDEFO95238 335 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 IGSF6O95976 241 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C1QTNF9P0C862 333 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HSD11B1P28845 292 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 BTCP35070 178 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 IGFALSP35858 605 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GPR4P46093 362 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RAG2P55895 527 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GTF2H3Q13889 308 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZSR6 202 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PIP4P1Q86T03 277 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MMP21Q8N119 569 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 EID2Q8N6I1 236 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR10A6Q8NH74 314 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF583Q96ND8 569 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 LGR4Q9BXB1 951 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.65□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 APC2O95996 2303 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 A6NNC1 897 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CLCA1A8K7I4 914 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TLR4O00206 839 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CTAG2O75638 210 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SC5DO75845 299 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ADAP00813 363 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PCCBP05166 539 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C8GP07360 202 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PRR35P0CG20 571 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF35P13682 527 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 UGT2B7P16662 529 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HTR2AP28223 471 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 DAPP51397 102 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NXPH1P58417 271 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PPP3R1P63098 170 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SSX1Q16384 188 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GSG1Q2KHT4 349 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MESTQ5EB52 335 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CNIH2Q6PI25 160 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MGLLQ99685 303 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GINS4Q9BRT9 223 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HDAC8Q9BY41 377 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ARL6Q9H0F7 186 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 AIG1Q9NVV5 245 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CACNA1BQ00975 2339 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HMSDA8MTL9 139 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CCSO14618 274 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GPR39O43194 453 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 DNAJB6O75190 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR4F21O95013 312 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 IL1AP01583 271 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TFP02787 698 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SFTPBP07988 381 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C1SP09871 688 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NPIPA8P0DM63 369 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RAB5AP20339 215 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SDC2P34741 201 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PRR5P85299 388 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NFKB2Q00653 900 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PCID2Q5JVF3 399 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.64□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms