RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531900.1

GPATCH4-216, Transcript of G-patch domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene GPATCH4, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH4-216ENST00000531900 GSTA4O15217 222 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 LYZL6O75951 148 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 PRSS23O95084 383 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 HPRP00739 348 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 IFNW1P05000 195 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 T-ENOLP0DO92 83 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TNFRSF1BP20333 461 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TAS2R41P59536 307 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TGFBR3Q03167 851 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 PUDPQ08623 228 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ST3GAL3Q11203 375 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 FAPQ12884 760 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 IFI44LQ53G44 452 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 GLYATQ6IB77 296 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 C16orf89Q6UX73 402 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 CASP12Q6UXS9 341 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 VTCN1Q7Z7D3 282 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 P3H2Q8IVL5 708 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 KDM8Q8N371 416 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TPD52L3Q96J77 140 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 CDRT15Q96T59 188 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ASPNQ9BXN1 380 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 C1orf21Q9H246 121 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NANSQ9NR45 359 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.51□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 LRRN3E7EW58 273 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ATE1O95260 518 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SERPINA1P01009 418 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 IGHV3-9P01782 118 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 CALB2P22676 271 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 IFNA8P32881 189 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SELENOPP49908 381 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC25A3Q00325 362 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 PMS2P3Q13401 168 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TSC22D1Q15714 1073 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 STK11Q15831 433 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 DEF8Q6ZN54 512 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 UEVLDQ8IX04 471 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM123Q8N131 208 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 RNF217Q8TC41 542 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM239Q8WW34 195 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MUCL1Q96DR8 90 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 C7orf34Q96L11 122 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ADA2Q9NZK5 511 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 UPB1Q9UBR1 384 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.5□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 MTORP42345 2549 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 B2RBV5 119 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NPIPB4C9JG80 1138 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TMCC2O75069 709 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 GMNNO75496 209 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF682O95780 498 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 CH25HO95992 272 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SEMG1P04279 462 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 HLA-DOBP13765 273 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 NCK1P16333 377 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 UGT2B15P54855 530 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 CLDN17P56750 224 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 PPA1Q15181 289 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF627Q7L945 461 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 WDR31Q8NA23 367 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.49□□□□□ -0.89
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms