RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 STK35Q8TDR2 534 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM234Q8WY98 164 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SMPDL3BQ92485 455 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LMF1Q96S06 567 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DDOQ99489 341 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MNTQ99583 582 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LPAR4Q99677 370 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SP140LQ9H930 580 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GALNT8Q9NY28 637 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf172C9J069 976 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MCIDASD6RGH6 385 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 WWP2O00308 870 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CDRT1O95170 752 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA3P01011 423 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CD63P08962 238 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MSX1P28360 303 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SDHAP31040 664 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 UQCRC1P31930 480 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 EVI2BP34910 448 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MTNR1BP49286 362 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 EFNA3P52797 238 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC16A1P53985 500 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DLX5P56178 289 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 RIPPLY3P57055 190 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DEFA1P59665 94 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 DEFA3P59666 94 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 FABP5Q01469 135 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC58Q4VC31 144 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ALG10Q5BKT4 473 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C22orf42Q6IC83 251 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM205Q6UW68 189 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SHFQ7M4L6 423 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GRINAQ7Z429 371 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MARCH3Q86UD3 253 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TPRA1Q86W33 373 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 KLBQ86Z14 1044 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TEX19Q8NA77 164 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GATSQ8NAP1 163 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 PHYHIPQ92561 330 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SNX18Q96RF0 628 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MED20Q9H944 212 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SDK2Q58EX2 2172 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 NINQ8N4C6 2090 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 A8MVM7 634 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 MEN1O00255 615 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 GNB5O14775 395 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OIP5O43482 229 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 RNF13O43567 381 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T1O43869 369 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM127O75204 238 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A12O75746 678 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms