RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CROCCP3Q8IVE0 287 aa19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 PARD6AQ9NPB6 346 aa19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
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SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
SH3BP5-204ENST00000412806 SIAEQ9HAT2 523 aa19.45■□□□□ 0.7
SH3BP5-204ENST00000412806 PROK2Q9HC23 129 aa19.45■□□□□ 0.7
SH3BP5-204ENST00000412806 DOCK10Q96BY6 2186 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP5-204ENST00000412806 ALPK2Q86TB3 2170 aa19.44■□□□□ 0.7
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