RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 OR10A5Q9H207 317 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 SERINC4A6NH21 518 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 PRAF2O60831 178 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 ICAM2P13598 275 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 CAPZBP47756 277 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 GAB1Q13480 694 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 GPR50Q13585 617 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 MED20Q9H944 212 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 LYRM4Q9HD34 91 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 FGF21Q9NSA1 209 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 HHLA2Q9UM44 414 aa16.03■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 FZD2Q14332 565 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 AGERQ15109 404 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 P2RY14Q15391 338 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 TPRA1Q86W33 373 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 MISPQ8IVT2 679 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 FRMD1Q8N878 549 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 F5H5K5 113 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 CTNSO60931 367 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 CD1EP15812 388 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 RAB3AP20336 220 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 PXKQ7Z7A4 578 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 PHB2Q99623 299 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.02■□□□□ 0.16
GAREM2-202ENST00000407684 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 LILRA5A6NI73 299 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 DDOSTP39656 456 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 PLK5Q496M5 336 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 GPR157Q5UAW9 335 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF529Q6P280 563 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 PPP1R35Q8TAP8 253 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 OR5M11Q96RB7 305 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 F13BP05160 661 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 GIFP27352 417 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 NRARPQ7Z6K4 114 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.02■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 EFCAB7A8K855 629 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 NCR1O76036 304 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ARSBP15848 533 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ARL11Q969Q4 196 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ELP4Q96EB1 424 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 IGHG1P01857 330 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 M6PRP20645 277 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 CDC6Q99741 560 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 APMAPQ9HDC9 416 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 C2orf72A6NCS6 295 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SSTR2P30874 369 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ARG2P78540 354 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 RUNX2Q13950 521 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 MMP21Q8N119 569 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SYT3Q9BQG1 590 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 GPRIN2O60269 458 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 TSPAN15O95858 294 aa16.01■□□□□ 0.15
GAREM2-202ENST00000407684 BEST4Q8NFU0 473 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms