RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 OSTF1Q92882 214 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 MIB2Q96AX9 1013 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 ADGRG7Q96K78 797 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN6-202ENST00000394765 NDUFB2O95178 105 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 RCBTB2O95199 551 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HIST1H2ABP04908 130 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TSPAN19P0C672 248 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ENPP1P22413 925 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 P2RY4P51582 365 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CLDN18P56856 261 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PGGHGQ32M88 737 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ALG10Q5BKT4 473 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 OR2T33Q8NG76 320 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TBC1D15Q8TC07 691 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 APH1BQ8WW43 257 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 EXO5Q9H790 373 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CXCL13O43927 109 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 GABARAPL2P60520 117 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SGCBQ16585 318 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SIAH3Q8IW03 269 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 OR52L1Q8NGH7 329 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 OR10D3Q8NH80 312 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 RASD2Q96D21 266 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ASPNQ9BXN1 380 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.01■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TMEM8BA6NDV4 472 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 FAM183AA6NL82 134 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PFDN1O60925 122 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 INHBBP09529 407 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF708P17019 499 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SMSP52788 366 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CTXN1P60606 82 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 FOXK2Q01167 660 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HBMQ6B0K9 141 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TIMP4Q99727 224 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 RHNO1Q9BSD3 238 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 RNF13O43567 381 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 GABRB1P18505 474 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 FMO3P31513 532 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PRPS1P60891 318 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 NFATC3Q12968 1075 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 MELKQ14680 651 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 GPAT4Q86UL3 456 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 Q96M85 177 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CHST11Q9NPF2 352 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 ACACBO00763 2458 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SURF4O15260 269 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PMS2P2O95744 297 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HTR1AP08908 422 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SLC6A6P31641 620 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 CARD18P57730 90 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 H3F3AP84243 136 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 EFNB1P98172 346 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 PUDPQ08623 228 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 TMED1Q13445 227 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-202ENST00000394765 SNAPC1Q16533 368 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms