RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DDA1Q9BW61 102 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT8Q9NY28 637 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 MSX1P28360 303 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SDC2P34741 201 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DLX5P56178 289 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TP53I3Q53FA7 332 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 RPTNQ6XPR3 784 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PALMDQ9NP74 551 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 INIPQ9NRY2 104 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 COPS3Q9UNS2 423 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CD8B2A6NJW9 211 aa20.54■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF9O43307 516 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T1O43869 369 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DPB1P04440 258 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CD8BP10966 210 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 RORCP51449 518 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DHRS13Q6UX07 377 aa20.54■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 OR6V1Q8N148 313 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF511Q8NB15 262 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SPRY4Q9C004 299 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM30A4D0T7 59 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CTDSP2O14595 271 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DVL2O14641 736 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 EFNA2O43921 213 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 MT-CO3P00414 261 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IL1AP01583 271 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 WDSUB1Q8N9V3 476 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR2M3Q8NG83 312 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SYT4Q9H2B2 425 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SIAEQ9HAT2 523 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQ72 361 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TP53I11O14683 189 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR6A2O95222 327 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IGHEP01854 428 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 S100A5P33763 92 aa20.53■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 KDM8Q8N371 416 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 POC1BQ8TC44 478 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ASB15Q8WXK1 588 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.53■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.52■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.52■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 FNDC8Q8TC99 324 aa20.52■□□□□ 0.88
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VSTM4-201ENST00000298454 WDR70Q9NW82 654 aa20.52■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 MOKQ9UQ07 419 aa20.52■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 A0A075B6Q4 140 aa20.51■□□□□ 0.87
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VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DOBP13765 273 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SSR4P51571 173 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 RPL27P61353 136 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T4Q8NH00 348 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 SNX33Q8WV41 574 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM4-201ENST00000298454 COQ7Q99807 217 aa20.51■□□□□ 0.87
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