RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 MmabQ9D273 237 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 MtfmtQ9D799 386 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 ScelQ9EQG3 652 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cts6Q9ET52 334 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Praf2Q9JIG8 178 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hacl1Q9QXE0 581 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Scn11aQ9R053 1765 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 1700023F06RikA2AB62 382 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr74A2BHP6 318 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8973D3YX71 104 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1511E9PWU0 318 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r77E9PY60 306 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1510E9PZZ6 318 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm3327F7C9A1 213 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21800J3QMJ9 180 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 TertO70372 1122 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nid1P10493 1245 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ctla2aP12399 137 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp59P16373 634 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hoxb1P17919 297 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hoxb9P20615 250 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nkx3-2P97503 333 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 4930480E11RikQ0VG34 394 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem104Q3TB48 496 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bahd1Q497V6 772 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm11492Q5ND19 536 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Epha1Q60750 977 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Art1Q60935 325 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cnih3Q6ZWS4 160 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fpr-rs7Q71MR7 338 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Spaca9Q7TPM5 168 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Csnk1a1Q8BK63 337 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 PgghgQ8BP56 690 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 H1fntQ8CJI4 398 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 FuomQ8R2K1 153 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr77Q8VEY9 312 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr161Q8VGB9 313 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mrgpra8Q91ZC4 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mrps18aQ99N85 196 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Metap1dQ9CPW9 335 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trappc6bQ9D289 158 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Psma1Q9R1P4 263 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 AireQ9Z0E3 552 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm15155B1B034 138 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm1330D3Z460 184 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm21411J3KMS0 136 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 MagixQ4KL35 324 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 HykkQ5U5V2 376 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr140Q60878 302 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 ItpkcQ7TS72 678 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Klhl13Q80TF4 654 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rims3Q80U57 307 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Prss27Q8BJR6 328 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr516Q8VFZ5 314 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1298Q8VGE6 312 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 RhebQ921J2 184 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rassf1Q99MK9 340 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ier3ip1Q9CR20 82 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gtpbp8Q9CY28 285 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ints12Q9D168 461 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr27Q9EQ90 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dnajb8Q9QYI7 227 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 IsxA1A546 240 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Macc1E9PXX8 851 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 AipO08915 330 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ninj1O70131 152 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd28P31041 218 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 CcnfP51944 777 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cpt2P52825 658 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zdhhc2P59267 366 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 ToxQ66JW3 526 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Alkbh2Q6P6J4 239 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trim46Q7TNM2 759 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1463Q7TQR3 310 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 P2ry10bQ8BY68 352 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr116Q923Q6 321 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ctrb1Q9CR35 263 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Efcab11Q9D0E5 162 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trpv4Q9EPK8 871 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Psma6Q9QUM9 246 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Acss2Q9QXG4 701 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dmrt1Q9QZ59 374 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Scn9aQ62205 1984 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1039A2ARY0 319 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm9047B9EJX3 177 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8024L7N2E0 100 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 RfngO09009 332 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp40-201ENSMUST00000040783 Il6P08505 211 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.2 ms