Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ctrb1Q9CR35 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ctrb1Q9CR35 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctrb1Q9CR35 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctrb1Q9CR35 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctrb1Q9CR35 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctrb1Q9CR35 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctrb1Q9CR35 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctrb1Q9CR35 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctrb1Q9CR35 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctrb1Q9CR35 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctrb1Q9CR35 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctrb1Q9CR35 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctrb1Q9CR35 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctrb1Q9CR35 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctrb1Q9CR35 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctrb1Q9CR35 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctrb1Q9CR35 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctrb1Q9CR35 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctrb1Q9CR35 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctrb1Q9CR35 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctrb1Q9CR35 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctrb1Q9CR35 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctrb1Q9CR35 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctrb1Q9CR35 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctrb1Q9CR35 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctrb1Q9CR35 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctrb1Q9CR35 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ctrb1Q9CR35 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctrb1Q9CR35 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctrb1Q9CR35 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctrb1Q9CR35 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctrb1Q9CR35 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctrb1Q9CR35 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctrb1Q9CR35 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctrb1Q9CR35 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctrb1Q9CR35 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctrb1Q9CR35 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctrb1Q9CR35 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctrb1Q9CR35 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctrb1Q9CR35 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctrb1Q9CR35 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctrb1Q9CR35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctrb1Q9CR35 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctrb1Q9CR35 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctrb1Q9CR35 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctrb1Q9CR35 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctrb1Q9CR35 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctrb1Q9CR35 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctrb1Q9CR35 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctrb1Q9CR35 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctrb1Q9CR35 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctrb1Q9CR35 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctrb1Q9CR35 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctrb1Q9CR35 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctrb1Q9CR35 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctrb1Q9CR35 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctrb1Q9CR35 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctrb1Q9CR35 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctrb1Q9CR35 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctrb1Q9CR35 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctrb1Q9CR35 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctrb1Q9CR35 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctrb1Q9CR35 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctrb1Q9CR35 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctrb1Q9CR35 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctrb1Q9CR35 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctrb1Q9CR35 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctrb1Q9CR35 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctrb1Q9CR35 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctrb1Q9CR35 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctrb1Q9CR35 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctrb1Q9CR35 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctrb1Q9CR35 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctrb1Q9CR35 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctrb1Q9CR35 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctrb1Q9CR35 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctrb1Q9CR35 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctrb1Q9CR35 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctrb1Q9CR35 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctrb1Q9CR35 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctrb1Q9CR35 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctrb1Q9CR35 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctrb1Q9CR35 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctrb1Q9CR35 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctrb1Q9CR35 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctrb1Q9CR35 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctrb1Q9CR35 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctrb1Q9CR35 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctrb1Q9CR35 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctrb1Q9CR35 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctrb1Q9CR35 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctrb1Q9CR35 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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