RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MYO10	Q9HD67	2058 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A1B0GX78	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A1W2PPC1	479 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HMX3	A6NHT5	357 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CD8B2	A6NJW9	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF879	B4DU55	563 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914		J3QLW9	94 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	AQP7	O14520	342 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HPGDS	O60760	199 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TPPP	O94811	219 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MT-ATP6	P00846	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TACSTD2	P09758	323 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRKAR1A	P10644	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CD8B	P10966	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF19	P17023	458 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPI1	P17947	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	NAT1	P18440	290 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	NPR2	P20594	1047 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SDHA	P31040	664 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HOXA6	P31267	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	UQCRC1	P31930	480 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	DDOST	P39656	456 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	NR4A2	P43354	598 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HTR3A	P46098	478 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	BLVRA	P53004	296 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PNLIPRP2	P54317	469 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TPTE	P56180	551 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SIRPA	P78324	504 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ERV3-1	Q14264	604 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CDK5R1	Q15078	307 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MISP	Q8IVT2	679 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SHISA5	Q8N114	240 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q8N402	240 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR6S1	Q8NH40	331 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR4K13	Q8NH42	304 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF721	Q8TF20	911 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	THRSP	Q92748	146 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	RERGL	Q9H628	205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	FKRP	Q9H9S5	495 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MMP25	Q9NPA2	562 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	NCDN	Q9UBB6	729 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SHISA3	A0PJX4	238 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM221	A6NGB7	291 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914		E9PI62	339 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDCD5	O14737	125 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PHYH	O14832	338 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	LRRTM2	O43300	516 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSPAN2	O60636	221 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCNK	O75909	580 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF432	O94892	652 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	ONECUT2	O95948	504 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	TF	P02787	698 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIST1H2AB	P04908	130 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRT8	P05787	483 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	UCHL1	P09936	223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PGC	P20142	388 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	IL12B	P29460	328 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	PYCR1	P32322	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFTUD2-208	ENST00000587914	THBS2	P35442	1172 aa		6.54	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms