RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 GPR68Q15743 365 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CPTPQ5TA50 214 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 STEAP4Q687X5 459 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MARCH3Q86UD3 253 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 KLHL29Q96CT2 875 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 KLHL15Q96M94 604 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TRMOQ9BU70 441 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 KLK15Q9H2R5 256 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 RHOJQ9H4E5 214 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 FKRPQ9H9S5 495 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TIGARQ9NQ88 270 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 VDAC3Q9Y277 283 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 RYR3Q15413 4870 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1W2PRB8 838 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 B4DSR2 109 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MGST3O14880 152 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 RGS14O43566 566 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 PLOD3O60568 738 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 STAMBPO95630 424 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NPIPA8P0DM63 369 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 IGHV1-2P23083 117 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TACR3P29371 465 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 KHKP50053 298 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 RPS6KA3P51812 740 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 SLC12A2P55011 1212 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CARTPTQ16568 116 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 LIPMQ5VYY2 423 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 APOOLQ6UXV4 268 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 FCRLAQ7L513 359 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 SLC43A2Q8N370 569 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 METTL4Q8N3J2 472 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TEX9Q8N6V9 391 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 CFAP36Q96G28 342 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 RNF145Q96MT1 663 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 NPAS1Q99742 590 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MED17Q9NVC6 651 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 THAP1Q9NVV9 213 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ASIC5Q9NY37 505 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 AHSPQ9NZD4 102 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 ACOT9Q9Y305 439 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 MED12Q93074 2177 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00640-204ENST00000557295 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 TSPAN4O14817 238 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 KERAO60938 352 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 UTS2O95399 124 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 ANGPTL1O95841 491 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 NGFRP08138 427 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 PGCP20142 388 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 EDNRAP25101 427 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 ELK4P28324 431 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 ELK3P41970 407 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 DECR1Q16698 335 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 FRG2Q64ET8 278 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 ISCA2Q86U28 154 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 TEX29Q8N6K0 151 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00640-204ENST00000557295 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms