RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 EDARQ9UNE0 448 aa6.61□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 RASD1Q9Y272 281 aa6.61□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ACANP16112 2415 aa6.61□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ARID1AO14497 2285 aa6.61□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PLCE1Q9P212 2302 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 DPRXA6NFQ7 191 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 OR5H1A6NKK0 313 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PDLIM1O00151 329 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NME4O00746 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CLOCKO15516 846 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CHP2O43745 196 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 FZD7O75084 574 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 UPK3AO75631 287 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HPRP00739 348 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 BGLAPP02818 100 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DOBP13765 273 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ZNF43P17038 809 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 OR1E2P47887 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 SLC7A2P52569 658 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NR1H2P55055 460 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CLDN17P56750 224 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 IL1RL1Q01638 556 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 BSPH1Q075Z2 132 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PPA1Q15181 289 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 GABRA6Q16445 453 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NIPAL3Q6P499 406 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 DEF8Q6ZN54 512 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 OR52N5Q8NH56 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NEUROG1Q92886 237 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MBD6Q96DN6 1003 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MUCL1Q96DR8 90 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TPD52L3Q96J77 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MUS81Q96NY9 551 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 OXGR1Q96P68 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 EPYCQ99645 322 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 BAG5Q9UL15 447 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.6□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MS4A18H0YCH9 400 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CXCR6O00574 342 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 DYNC1I1O14576 645 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 KRT33AO76009 404 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CH25HO95992 272 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 IFNA14P01570 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 CD3EP07766 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MPGP29372 298 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 GSK3BP49841 420 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ZNF83P51522 516 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TAS2R41P59536 307 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PSME3P61289 254 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 SLC25A3Q00325 362 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PMS2P3Q13401 168 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 LINGO2Q7L985 606 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 SCAIQ8N9R8 606 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 WDR31Q8NA23 367 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.59□□□□□ -1.35
PATJ-211ENST00000493967 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.59□□□□□ -1.35
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