RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA8P32881 189 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GSSP48637 474 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CUL2Q13617 745 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PRR22Q8IZ63 422 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ITCHQ96J02 903 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NAT9Q9BTE0 207 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PISDQ9UG56 409 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CHD4Q14839 1912 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YXY3 114 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPV9 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 AGPAT2O15120 278 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PSTPIP1O43586 416 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 AGTP01019 485 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CST1P01037 141 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FGF1P05230 155 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 KITLGP21583 273 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CHMLP26374 656 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 APOC4P55056 127 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT2P55345 433 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 DLX1P56177 255 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 STX17P56962 302 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ2P63252 427 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TGFBR3Q03167 851 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6AP1Q15904 470 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf223Q8N319 242 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 UCN3Q969E3 161 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ERLIN2O94905 339 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 RCN1Q15293 331 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR2L5Q8NG80 312 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TSG101Q99816 390 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PRR34Q9NV39 138 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 RAB20Q9NX57 234 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NSD2O96028 1365 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SERPIND1P05546 499 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 C2P06681 752 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R19P59542 299 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CCNA1P78396 465 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PPIL2Q13356 520 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NSDHLQ15738 373 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CARD17Q5XLA6 110 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL16Q8N461 479 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C4Q8NGE1 309 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 CENPKQ9BS16 269 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 OR51J1Q9H342 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 GLRX2Q9NS18 164 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 NUP50Q9UKX7 468 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 DYNC1I1O14576 645 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SOX15O60248 233 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ABOP16442 354 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A5P22732 501 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TGFBIQ15582 683 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 RAET1LQ5VY80 246 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF544Q6NX49 715 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF546Q86UE3 836 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01006Q8NI28 216 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 HSFY1Q96LI6 401 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 TECTBQ96PL2 329 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 LY9Q9HBG7 655 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ENPEPQ07075 957 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 XKR7Q5GH72 579 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 CASC10Q5T4H9 136 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OTPQ5XKR4 325 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 GPR151Q8TDV0 419 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 OR8B4Q96RC9 309 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-212ENST00000491302 SORT1Q99523 831 aa5.45□□□□□ -1.54
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