RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SCAIQ8N9R8 606 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 NRGNQ92686 78 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 PRRC1Q96M27 445 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 CH25HO95992 272 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 MT-ATP6P00846 226 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 HSD17B1P14061 328 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 SELENOPP49908 381 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 CLDN17P56750 224 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 PMS2P3Q13401 168 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 TAB1Q15750 504 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 STK11Q15831 433 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 ZNF74Q16587 644 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 CDH24Q86UP0 819 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 CD300AQ9UGN4 299 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 ITPR2Q14571 2701 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-205ENST00000426683 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 CIB4A0PJX0 185 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 B2RBV5 119 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MS4A18H0YCH9 400 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 RAD51DO75771 328 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 HPRP00739 348 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 THRBP10828 461 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 IFNA8P32881 189 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 UGT2B15P54855 530 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 ST3GAL3Q11203 375 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MS4A18Q3C1V0 323 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 UEVLDQ8IX04 471 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 POMGNT2Q8NAT1 580 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 OR5J2Q8NH18 312 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 TMEM239Q8WW34 195 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 HSD17B8Q92506 261 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 FKRPQ9H9S5 495 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MPDZO75970 2070 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPR1 153 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 ENO4A6NNW6 628 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 J3KTA2 159 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 PDLIM1O00151 329 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 PLPP3O14495 311 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 KLF4O43474 513 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 KRT33AO76009 404 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 ITGA5P08648 1049 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 UMPSP11172 480 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 HLA-DOBP13765 273 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 CALB2P22676 271 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 AHCYP23526 432 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 PUDPQ08623 228 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 FXNQ16595 210 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 BEX5Q5H9J7 111 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 PFN4Q8NHR9 129 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 LIME1Q9H400 295 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 GORASP2Q9H8Y8 452 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 NANSQ9NR45 359 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 RHCGQ9UBD6 479 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 RCE1Q9Y256 329 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 APCP25054 2843 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 UPK3AO75631 287 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 OR6A2O95222 327 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 MT-ND1P03886 318 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 ADORA3P0DMS8 318 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 LGALS3BPQ08380 585 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 OFCC1Q8IZS5 231 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-205ENST00000426683 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms