RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 MAP2K6P52564 334 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 GABARAPL2P60520 117 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TEKQ02763 1124 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 AADACL4Q5VUY2 407 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ZNF773Q6PK81 442 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 FAM122BQ7Z309 247 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PTP4A1Q93096 173 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SCMH1Q96GD3 660 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PIGQQ9BRB3 760 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PRRG3Q9BZD7 231 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 DPPA5A6NC42 116 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ZNF17P17021 662 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ID4P47928 161 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 STARP49675 285 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CLDN20P56880 219 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ZNF91Q05481 1191 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A30Q5SVS4 291 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TMEM251Q8N6I4 163 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 NMNAT3Q96T66 252 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 COPS4Q9BT78 406 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ASPNQ9BXN1 380 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 FN3KQ9H479 309 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 FKBP14Q9NWM8 211 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SLC6A5Q9Y345 797 aa18.1■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CACNA1AO00555 2505 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 A0A087WXM4 84 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SH3D21A4FU49 640 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 MS4A18H0YCH9 400 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 RNF13O43567 381 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 GYPBP06028 91 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CD14P08571 375 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 STSP08842 583 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 DIO1P49895 249 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PMP22Q01453 160 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ITGADQ13349 1161 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SPARTQ8N0X7 666 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TMEM99Q8N816 258 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 OR2B2Q9GZK3 357 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 BAIAP2Q9UQB8 552 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 BSNQ9UPA5 3926 aa18.09■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 RIIAD1A6NNX1 92 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 RAMP1O60894 148 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 GLSO94925 669 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 MT-ND2P03891 347 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SLC15A1P46059 708 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 OR2B6P58173 313 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PLGLB1Q02325 96 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 TLE3Q04726 772 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SLC37A3Q8NCC5 494 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 OR6S1Q8NH40 331 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 Q96MT0 163 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SFXN2Q96NB2 322 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
ODC1-202ENST00000405333 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 H7C1C5 153 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 K7EM74 188 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 ARPC3O15145 178 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 PDGFAP04085 211 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 MAP2K4P45985 399 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 LCN6P62502 163 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 ST3GAL4Q11206 333 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 NEDD8Q15843 81 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 SHFQ7M4L6 423 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 SATL1Q86VE3 508 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 SLC43A2Q8N370 569 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 ALKBH4Q9NXW9 302 aa18.08■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa18.07■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 A0A0J9YW62 118 aa18.07■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 SULT2B1O00204 365 aa18.07■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 TNFSF11O14788 317 aa18.07■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 PRODHO43272 600 aa18.07■□□□□ 0.48
ODC1-202ENST00000405333 ADRB1P08588 477 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms