RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OR12D2P58182 307 aa16.18■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 GGTLC2Q14390 218 aa16.18■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 OR2T7P0C7T2 308 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 AHCYP23526 432 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 CT55Q8WUE5 264 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 PALMDQ9NP74 551 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 INIPQ9NRY2 104 aa16.16■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 COPS3Q9UNS2 423 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 ALPK2Q86TB3 2170 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 TTC28Q96AY4 2481 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.15■□□□□ 0.18
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ACTB-201ENST00000331789 CTDSP2O14595 271 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 EFNA2O43921 213 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 JMJD7P0C870 316 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 MSX1P28360 303 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-201ENST00000331789 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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