RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SnupnQ80W37 358 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sgpp2Q810K3 354 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt15Q8BG93 170 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup107Q8BH74 926 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ino80cQ8BHA0 191 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mal2Q8BI08 175 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10330Q8BKS1 112 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Catsper4Q8BVN3 442 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Coro2aQ8C0P5 524 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb37Q8C3U9 504 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhno1Q8K3A4 235 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r208Q8R275 308 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CthQ8VCN5 398 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr866Q8VFI7 312 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1423Q8VFV0 310 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr170Q8VGL6 313 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr658Q8VGV5 323 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mgat2Q921V5 442 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubqln4Q99NB8 596 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspan31Q9CQ88 210 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Emc4Q9CZX9 183 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex47Q9D5W8 253 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpep3Q9DA79 493 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr930Q9EQ99 308 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tor1aQ9ER39 333 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trappc4Q9ES56 219 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ntn4Q9JI33 628 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcb10Q9JI39 715 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcea2Q9QVN7 299 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prss16Q9QXE5 509 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plod2Q9R0B9 737 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr545Q9WU94 316 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stub1Q9WUD1 304 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LipgQ9WVG5 500 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cxcl15Q9WVL7 167 aa8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A286YD17 136 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smim17A0A504 109 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14418A2ARR6 358 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14322A2AW66 358 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sac3d1A6H687 427 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp362B1ASA5 418 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CK137956B1AYM9 596 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC035947B2RQY6 695 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdzd8B9EJ80 1147 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8159E9Q0R1 267 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt83E9Q1Y9 479 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21876F6XK35 94 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr66F8VQ01 311 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb25G3UW50 439 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 S100a2J3QMC7 104 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grap2O89100 322 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdk1P11440 297 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cst3P21460 140 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxc5P32043 222 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pax4P32115 349 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FshrP35378 692 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eci1P42125 289 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdx2P43241 311 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 StsP50427 624 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6v1e1P50518 226 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ackr3P56485 362 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pou3f4P62515 361 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cab39Q06138 341 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rspo3Q2TJ95 277 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdss2Q33DR3 401 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm1604bQ3TRG0 118 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC030870Q3V2G4 71 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Commd6Q3V4B5 87 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IspdQ5RJG7 447 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr12Q60894 333 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sdc3Q64519 442 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 St8sia1Q64687 355 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a13Q6A4L0 551 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ParpbpQ6IRT3 573 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r107Q7M725 308 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PigvQ7TPN3 493 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr645Q7TRQ1 315 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl13Q80TF4 654 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21627Q810R0 219 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Katnb1Q8BG40 658 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adprhl1Q8BGK2 353 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mettl27Q8BGM4 238 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Flrt3Q8BGT1 649 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem30bQ8BHG3 353 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lkaaear1Q8BIG2 198 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NarsQ8BP47 559 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prkd2Q8BZ03 875 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RfesdQ8K2P6 157 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nmral1Q8K2T1 309 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cbr3Q8K354 277 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf768Q8R0T2 568 aa8.47□□□□□ -1.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2afjQ8R1M2 129 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms