Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Sdc3Q64519 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sdc3Q64519 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sdc3Q64519 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sdc3Q64519 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Sdc3Q64519 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sdc3Q64519 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sdc3Q64519 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Sdc3Q64519 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sdc3Q64519 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sdc3Q64519 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sdc3Q64519 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sdc3Q64519 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sdc3Q64519 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sdc3Q64519 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sdc3Q64519 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Sdc3Q64519 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sdc3Q64519 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sdc3Q64519 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sdc3Q64519 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sdc3Q64519 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sdc3Q64519 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sdc3Q64519 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sdc3Q64519 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sdc3Q64519 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sdc3Q64519 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sdc3Q64519 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sdc3Q64519 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Sdc3Q64519 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sdc3Q64519 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdc3Q64519 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sdc3Q64519 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sdc3Q64519 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sdc3Q64519 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sdc3Q64519 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sdc3Q64519 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sdc3Q64519 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sdc3Q64519 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sdc3Q64519 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sdc3Q64519 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdc3Q64519 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sdc3Q64519 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdc3Q64519 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sdc3Q64519 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdc3Q64519 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdc3Q64519 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sdc3Q64519 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sdc3Q64519 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sdc3Q64519 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdc3Q64519 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdc3Q64519 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sdc3Q64519 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sdc3Q64519 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sdc3Q64519 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sdc3Q64519 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sdc3Q64519 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sdc3Q64519 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdc3Q64519 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdc3Q64519 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sdc3Q64519 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sdc3Q64519 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sdc3Q64519 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sdc3Q64519 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sdc3Q64519 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sdc3Q64519 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sdc3Q64519 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdc3Q64519 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdc3Q64519 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sdc3Q64519 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdc3Q64519 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdc3Q64519 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc3Q64519 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sdc3Q64519 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sdc3Q64519 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdc3Q64519 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdc3Q64519 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sdc3Q64519 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sdc3Q64519 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdc3Q64519 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc3Q64519 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc3Q64519 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc3Q64519 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc3Q64519 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdc3Q64519 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sdc3Q64519 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc3Q64519 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdc3Q64519 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdc3Q64519 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc3Q64519 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdc3Q64519 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdc3Q64519 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdc3Q64519 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc3Q64519 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sdc3Q64519 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdc3Q64519 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms