Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Tor1aQ9ER39 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tor1aQ9ER39 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tor1aQ9ER39 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tor1aQ9ER39 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tor1aQ9ER39 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tor1aQ9ER39 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tor1aQ9ER39 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tor1aQ9ER39 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tor1aQ9ER39 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tor1aQ9ER39 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tor1aQ9ER39 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tor1aQ9ER39 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tor1aQ9ER39 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tor1aQ9ER39 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tor1aQ9ER39 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tor1aQ9ER39 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tor1aQ9ER39 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tor1aQ9ER39 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tor1aQ9ER39 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tor1aQ9ER39 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tor1aQ9ER39 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tor1aQ9ER39 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tor1aQ9ER39 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tor1aQ9ER39 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tor1aQ9ER39 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tor1aQ9ER39 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tor1aQ9ER39 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tor1aQ9ER39 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tor1aQ9ER39 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tor1aQ9ER39 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor1aQ9ER39 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor1aQ9ER39 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor1aQ9ER39 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tor1aQ9ER39 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tor1aQ9ER39 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tor1aQ9ER39 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tor1aQ9ER39 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tor1aQ9ER39 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tor1aQ9ER39 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tor1aQ9ER39 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tor1aQ9ER39 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tor1aQ9ER39 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tor1aQ9ER39 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tor1aQ9ER39 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tor1aQ9ER39 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tor1aQ9ER39 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tor1aQ9ER39 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tor1aQ9ER39 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tor1aQ9ER39 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tor1aQ9ER39 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tor1aQ9ER39 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tor1aQ9ER39 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tor1aQ9ER39 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tor1aQ9ER39 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tor1aQ9ER39 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tor1aQ9ER39 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tor1aQ9ER39 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tor1aQ9ER39 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tor1aQ9ER39 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tor1aQ9ER39 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tor1aQ9ER39 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tor1aQ9ER39 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tor1aQ9ER39 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tor1aQ9ER39 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tor1aQ9ER39 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tor1aQ9ER39 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tor1aQ9ER39 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tor1aQ9ER39 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tor1aQ9ER39 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tor1aQ9ER39 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tor1aQ9ER39 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tor1aQ9ER39 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tor1aQ9ER39 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tor1aQ9ER39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tor1aQ9ER39 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tor1aQ9ER39 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tor1aQ9ER39 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tor1aQ9ER39 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tor1aQ9ER39 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tor1aQ9ER39 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tor1aQ9ER39 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tor1aQ9ER39 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tor1aQ9ER39 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tor1aQ9ER39 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tor1aQ9ER39 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tor1aQ9ER39 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor1aQ9ER39 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1aQ9ER39 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor1aQ9ER39 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor1aQ9ER39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor1aQ9ER39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor1aQ9ER39 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor1aQ9ER39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor1aQ9ER39 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms