RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	NOX4	Q9NPH5	578 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC1B	Q9P126	229 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	COPS3	Q9UNS2	423 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	MOK	Q9UQ07	419 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0B4J203	849 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-34	P06331	123 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A1	P53007	311 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	AP3S2	P59780	193 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-25	P63136	954 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	BIK	Q13323	160 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SHH	Q15465	462 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL26	Q53HC5	615 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF527	Q8NB42	609 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	AVL9	Q8NBF6	648 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA3	Q8NG57	546 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	LIPH	Q8WWY8	451 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TCTN2	Q96GX1	697 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		16.84	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IFITM5	A6NNB3	132 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CTSB	P07858	339 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GALNS	P34059	522 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ADH7	P40394	386 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PGD	P52209	483 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B7	P56937	341 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GSG1	Q2KHT4	349 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RASD2	Q96D21	266 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ALG12	Q9BV10	488 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	16.83	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1B1	O43704	296 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	THEGL	P0DJG4	465 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GDNF	P39905	211 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB10	P40306	273 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FZD2	Q14332	565 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	NNAT	Q16517	81 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LEG1	Q6P5S2	330 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HMGB4	Q8WW32	186 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TTC9	Q92623	222 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IMPA2	O14732	288 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HPGD	P15428	266 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CCR6	P51684	374 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SERTAD2	Q14140	314 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HGD	Q93099	445 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GPR137	Q96N19	417 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SLITRK2	Q9H156	845 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GABARAP	H6UMI1	98 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA16	P05015	189 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CD14	P08571	375 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	BTG2	P78543	158 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LINGO2	Q7L985	606 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	DERL3	Q96Q80	235 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	NANS	Q9NR45	359 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MSRA	Q9UJ68	235 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		16.81	■□□□□ 0.28
RRN3-205	ENST00000563559		V9GY05	133 aa		16.81	■□□□□ 0.28

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