RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LAMA3	Q16787	3333 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRRG1	O14668	218 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MSH4	O15457	936 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF254	O75437	659 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BBOX1	O75936	387 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NDUFB10	O96000	172 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ALOX5	P09917	674 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UCHL3	P15374	230 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCMT1	P22061	227 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GDF1	P27539	372 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC25A1	P53007	311 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LAGE3	Q14657	143 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPA17	Q15506	151 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TGIF1	Q15583	401 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VASH2	Q86V25	355 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SERINC5	Q86VE9	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GPR65	Q8IYL9	337 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	METTL13	Q8N6R0	699 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM3C	Q92520	227 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM80	Q96HE8	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SENP8	Q96LD8	212 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RIT2	Q99578	217 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EDEM2	Q9BV94	578 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYH4	Q9Y623	1939 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COL4A5	P29400	1685 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VGLL3	A8MV65	326 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PHOX2A	O14813	284 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAGEB3	O15480	346 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BCL2L11	O43521	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPAG6	O75602	509 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRT14	P02533	472 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IVL	P07476	585 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TBXA2R	P21731	343 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLRA2	P23416	452 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ANXA13	P27216	316 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OTX2	P32243	289 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NF2	P35240	595 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	XCR1	P46094	333 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STAR	P49675	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ACTR1A	P61163	376 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GNGT1	P63211	74 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NDUFA9	Q16795	377 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MARC1	Q5VT66	337 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WSCD1	Q658N2	575 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C8orf74	Q6P047	294 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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